政府投资项目作为政府实现其宏观经济管理职能的重要手段，在我国经济活动中发挥着重要作用。随着国民经济的快速发展，中央和地方各级政府公共性基础设施等投资支出占财政支出的比例越来越大。如何运用好财政资金，确保建设项目质量，避免国有资金损失浪费，并保障政府投资项目取得良好的经济效益和社会效益，是审计机关面临的艰巨任务。

1999年2月，《国务院办公厅关于加强基础设施工程质量管理的通知》中，首次提出“对重大项目要进行专项审计和跟踪审计”的要求。2004年7月，国务院颁布的《关于投资体制改革的决定》特别指出，“审计机关要依法全面履行职责，进一步加强对政府投资项目的审计监督，提高政府投资管理水平和投资效益”。为加大对政府投资项目的审计监督力度，促进提高财政资金使用绩效，审计机关不断创新审计方式，将审计监督“关口”前移，开展了政府投资项目跟踪审计。